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蛋白胨研究編排對(duì)細(xì)胞自身穩(wěn)定的重要性
更新時(shí)間:2014-08-18   點(diǎn)擊次數(shù):734次

蛋白胨研究編排對(duì)細(xì)胞自身穩(wěn)定的重要性

  對(duì)于人類生物學(xué)與疾病來說,了解RNA結(jié)合

  在剪接過程中,不典型地編碼蛋白質(zhì)的片段稱為內(nèi)含子,從基因轉(zhuǎn)錄中被刪除,其余序列稱為外顯子,被重新連接。結(jié)合RNA的蛋白胨對(duì)剪接過程的控制很重要,它們結(jié)合的位置決定著RNA的哪一段在zui后的基因轉(zhuǎn)錄中被留下或刪除,在模式上與改變影片中情節(jié)的移除和插入場(chǎng)景,或?yàn)榧糨嬒嗤?/p>

  通過整合關(guān)于這些關(guān)鍵結(jié)合蛋白胨的大量信息,并廣泛應(yīng)用這些數(shù)據(jù),這將給建立剪接預(yù)測(cè)模型和將來如胚胎干細(xì)胞一樣的其他細(xì)胞研究提供基礎(chǔ)。如果能了解這些蛋白如何一起發(fā)揮作用并相互影響來調(diào)節(jié)可變剪接,將為合理設(shè)計(jì)藥物提供重要的線索。

  此項(xiàng)研究所強(qiáng)調(diào)的那些數(shù)據(jù)繪制出人類細(xì)胞中6個(gè)主要的核不均一核糖核蛋白胨(hnRNP)的功能性結(jié)合位點(diǎn),這些數(shù)據(jù)通過全基因組方法獲得,其中全基因組方法包括定制的剪接敏感芯片、確定全基因組結(jié)合位點(diǎn)(CLIP-seq)的RNA測(cè)序和高通量測(cè)序。

  已確定了這些hnRNP蛋白的數(shù)千計(jì)結(jié)合位點(diǎn)和可變剪接事件,這些蛋白令人驚訝地互相結(jié)合并互相調(diào)節(jié),其他RNA結(jié)合蛋白胨的整個(gè)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)表明這些蛋白對(duì)于細(xì)胞的自身穩(wěn)定很重要。

  在這項(xiàng)研究中,被RNA結(jié)合蛋白特異靶向的基因也經(jīng)常涉及癌癥。數(shù)以千計(jì)的遺傳突變出現(xiàn)在癌癥中,它們大部分出現(xiàn)在剪接期間被移除的內(nèi)含子里面;但是,內(nèi)含子區(qū)域是調(diào)節(jié)性hnRNP蛋白通常結(jié)合的位置所在。

  這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)表明了hnRNP蛋白間復(fù)雜且互為補(bǔ)充關(guān)系的一種的深度和它們的可能賦于細(xì)胞強(qiáng)壯的剪接目標(biāo)。RNA結(jié)合蛋白胨的編排不僅對(duì)細(xì)胞自身穩(wěn)定很重要,也通過繪制基因上結(jié)合位點(diǎn)與所有調(diào)節(jié)區(qū)域的位置揭示這一過程的瓦解如何引起疾病,也可能是一種干預(yù)途徑。

 

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